好氧发酵的流程一般包括以下几个步骤：
1. 添加原料：将原料添加到发酵容器中；
2. 煮沸：将发酵容器中的原料加热沸腾，使细菌死亡微生物数量减少；
3. 加入抑制剂：加入少量抑制剂，以防止贻贝或膨胀微生物的侵入；
4. 生化反应：以酶催化的方式进行生物合成，真菌以发酵方式向细胞内有机物注入氧等；
5. 冷却：将发酵液冷却；
6.过滤：将发酵液过滤，以提取溶解物和有机物；
7. 抽滤：将发酵液抽滤，将立体结构分离出来；
8. 灭菌：将发酵液做灭菌处理；
9. 贮存：将得到的发酵产品进行贮存处理。
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