1.加工番茄新品种选育
在昌吉市丰源农场建立200亩种质资源和新品种研发区。引进野生番茄资源、特异种质及国内外优良品系，通过杂交、回交、双交、三交、添加杂交等常规育种技术，联合中国农科院、新疆农科院等科技院校，结合分子标记技术，进行优异基因的聚合选育，创制具有耐盐、高固形物、高红素、低酸、高粘等农艺性状的新种质。利用现有的种质资源，结合常规育种技术及分子标记辅助育种技术，筛选优质高效机采品种。
2.加工番茄良种繁育体系建设
根据品种繁育特点，建立从原原种、原种、到良种的繁育技术体系和良种质量检测鉴定体系。严格按照《加工番茄杂交制种技术规程》（DB65/T 3234—2011）进行加工番茄杂交种繁育。
