1、水育秧法
整个育秧期间，秧田以淹水管理为主。水整地水作床，带水播种，出苗全过程除防治绵腐病、坏种烂秧及露田扎根外，一直都建立水层。该育秧方式常有坏种烂芽、出苗和成苗率较低、秧苗细长不壮、分蘖弱等弊端，是我国稻区采用的传统方法，现在在生产上已不提倡采用。
2、湿润育秧法
湿润育秧是介于水育秧和旱育秧之间的一种育秧方法，该育秧方式容易调节土壤中水气矛盾，播后出苗快，出苗整齐，不易发生生理性立枯病，有利于促进出苗扎根，防止烂芽死苗，也能较好地通过水分管理来促进和控制秧苗生长，已成为替代水育秧的基本育秧方法。
较为常用的是塑料薄膜湿润保温育秧法，在湿润育秧的基础上，播种后于厢面加盖一层薄膜，多为低拱架覆盖。这种育秧方式有利于保温、保湿、增温，可适时早播，防止烂芽、烂秧，提高成秧率，在早春播种预防低温冷害来说十分必要。
3、旱育秧法
整个育秧过程中，只保持土壤湿润，不保持水层的育秧方法。常见的肥床细土法塑盘旱育秧（大棚中）、开闭式薄膜旱育秧等方式已成为寒冷地区和双季早稻培育壮秧、抗寒、抗旱、节水的重要育秧方法。
肥床细土法塑盘旱育秧在肥沃疏松的秧床上，利用塑料软盘或纸筒进行旱育秧。
该育秧方法播种期不受水源限制，旱秧地育秧操作方便；适于大、中、小苗的培育，比塑料盘湿润育秧秧龄延长，且不串根，有利于高产品种的搭配和应用范围的扩大。另外，此方法便于统一供种，集中规模育种，并实现商品化供秧。塑盘旱育秧又是适宜机械抛秧的最佳育秧形式，具有广阔的前景。
