石材上水锈的清理方法有以下几种：
减少水对石材的使用，打磨时加防护剂，平时少用水拖地。
使用角磨机磨一下锈渍，然后铺上卫生纸一类吸水的东西，在卫生纸上加入除锈剂，最后铺上防护膜，等24小时以后观察效果，如果效果不太好，重复以上步骤。
使用纳米海绵轻轻擦拭大理石，可以去除水垢和水锈，纳米海绵具有强力去污能力且不需要清洁剂或其他材料辅助。
使用石材除锈剂，如花岗岩除锈剂（SINO-303）和大理石除锈剂（SINO-302），这些除锈剂能渗透进入石材内部清除锈斑，且不损害石材表面光泽。
使用表面活性剂进行清洗，表面活性剂有离子型和非离子型两种，通过降低界面张力、润湿、吸附、乳化、增溶、分散等性质使污垢分子脱落。
使用碱清洗，如氢氧化钠或碳酸钠溶液，用于消除油污和某些锈迹。
使用酸清洗，如盐酸、硫酸、硝酸等，用于去除锈迹，特别是对于花岗岩等耐酸性石材。
使用小苏打或柠檬去除水垢，将小苏打烧沸后淋在石头上刷洗，或把柠檬切片放入烧水壶煮沸后浸泡后淋在石头上刷洗。
使用牙膏或打磨机进行清理，牙膏可以用于轻微的锈迹，而打磨机可以用于更严重的锈迹。
建议
对于轻微的水锈，可以使用纳米海绵或小苏打等简单方法进行清洁。
对于较严重的水锈，建议使用专门的石材除锈剂，并按照说明书进行操作，以确保安全有效地去除锈迹。
在使用任何化学清洁剂之前，建议在不显眼的地方进行小范围测试，以确保不会损坏石材。
清洁完成后，应涂上防护剂以保护石材，防止水汽的进一步侵入。
