二手商铺交易涉及的税费主要包括以下几种：
通常为成交价的3元/平方米。
一般为550元/本，每增加一本证书按每本10元收取工本费。
通常是5元/本。
按照房屋成交价的0.05%计算。
按照评估价或成交价的3%计算。
根据增值额和扣除项目的不同，增值额未超过扣除项目金额50%的部分，税率为30%；增值额超过扣除项目金额50%但未超过100%的部分，税率为40%；增值额超过扣除项目金额100%但未超过200%的部分，税率为50%；增值额超过扣除项目金额200%的部分，税率为60%。
据实征收为（转让收入-房产原值-合理费用）×20%，核定征收为转让收入×7.5%×20%。
提供发票的情况下，增值税计算较为复杂，通常涉及城市维护建设税、教育费附加和地方教育附加等；不提供发票的情况下，增值税计算较为简单。
商业用途用房，按其网格点基准地价的35%计收。
以上税费计算方式可能因地区、时间以及具体政策变动而有所不同，建议在交易前咨询当地税务部门或专业税务顾问以获取最准确的信息
